Producción científica por año
Producción científica por año
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2024
Dynamic changes in mRNA nucleocytoplasmic localization in the nitrate response of Arabidopsis roots
Fonseca, A., Riveras, E., Moyano, T. C., Alvarez, J. M., Rosa, S. & Gutiérrez, R. A., 2024, (En prensa) En: Plant Cell and Environment.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto -
Filling the gaps on root hair development under salt stress and phosphate starvation using current evidence coupled with a meta-analysis approach
Ibeas, M. A., Salinas-Grenet, H., Johnson, N. R., Perez-Diaz, J., Vidal, E. A., Alvarez, J. M. & Estevez, J. M., 26 jun. 2024, En: Plant Physiology. 10 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
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Insights into molecular links and transcription networks integrating drought stress and nitrogen signaling
Cerda, A. & Alvarez, J. M., ene. 2024, En: New Phytologist. 241, 2, p. 560-566 7 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto3 Citas (Scopus) -
Nitrogen sensing and regulatory networks: it's about time and space
Shanks, C., Rothkegel, K., Brooks, M., Cheng, C., Alvarez, J., Ruffel, S., Krouk, G., Gutierrez, R. & Coruzzi, G., 1 may. 2024, En: Plant Cell. 36, 5, p. 1482-1503 22 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
Acceso abierto8 Citas (Scopus) -
2023
Cell surface receptor kinase FERONIA linked to nutrient sensor TORC signaling controls root hair growth at low temperature linked to low nitrate in Arabidopsis thaliana
Pacheco, J. M., Song, L., Kuběnová, L., Ovečka, M., Berdion Gabarain, V., Peralta, J. M., Lehuedé, T. U., Ibeas, M. A., Ricardi, M. M., Zhu, S., Shen, Y., Schepetilnikov, M., Ryabova, L. A., Alvarez, J. M., Gutierrez, R. A., Grossmann, G., Šamaj, J., Yu, F. & Estevez, J. M., abr. 2023, En: New Phytologist. 238, 1, p. 169-185 17 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
14 Citas (Scopus) -
DamID-seq: A Genome-Wide DNA Methylation Method that Captures Both Transient and Stable TF-DNA Interactions in Plant Cells: A Genome-Wide DNA Methylation Method that Captures Both Transient and Stable TF-DNA Interactions in Plant Cells
Alvarez, J. M., Hinckley, W. E., Leonelli, L., Brooks, M. D. & Coruzzi, G. M., 2023, En: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2698, p. 87-107 21 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
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NAC072 Interacts with HB12, HAT9, and MYBR1 in a Temporal Regulatory Network Controlling Peach Fruit Development
Núñez-Lillo, G., Zabala, J., Lillo-Carmona, V., Álvarez, J. M., Pedreschi, R. & Meneses, C., 2023, (En prensa) En: Journal of Plant Growth Regulation.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
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The Botrytis cinerea Gene Expression Browser
Pérez-Lara, G., Moyano, T. C., Vega, A., Larrondo, L. F., Polanco, R., Álvarez, J. M., Aguayo, D. & Canessa, P., ene. 2023, En: Journal of Fungi. 9, 1, 84.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto1 Cita (Scopus) -
2022
Comprehensive re-analysis of hairpin small RNAs in fungi reveals loci with conserved links
Johnson, N. R., Larrondo, L. F., Álvarez, J. M. & Vidal, E. A., dic. 2022, En: eLife. 11, e83691.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto4 Citas (Scopus) -
Molecular mechanisms underlying nitrate responses in plants
Lamig, L., Moreno, S., Álvarez, J. M. & Gutiérrez, R. A., 9 may. 2022, En: Current Biology. 32, 9, p. R433-R439Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
8 Citas (Scopus) -
Spatiotemporal analysis identifies ABF2 and ABF3 as key hubs of endodermal response to nitrate
Contreras-López, O., Vidal, E. A., Riveras, E., Alvarez, J. M., Moyano, T. C., Sparks, E. E., Medina, J., Pasquino, A., Benfey, P. N., Coruzzi, G. M. & Gutiérrez, R. A., 25 ene. 2022, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 4, e2107879119.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto22 Citas (Scopus) -
Transcriptome and Gene Regulatory Network Analyses Reveal New Transcription Factors in Mature Fruit Associated with Harvest Date in Prunus persica
Núñez-Lillo, G., Pérez-Reyes, W., Riveros, A., Lillo-Carmona, V., Rothkegel, K., Álvarez, J. M., Blanco-Herrera, F., Pedreschi, R., Campos-Vargas, R. & Meneses, C., dic. 2022, En: Plants. 11, 24, 3473.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto3 Citas (Scopus) -
Validation of a high-confidence regulatory network for gene-to-NUE phenotype in field-grown rice
Shanks, C. M., Huang, J., Cheng, C. Y., Shih, H. J. S., Brooks, M. D., Alvarez, J. M., Araus, V., Swift, J., Henry, A. & Coruzzi, G. M., 25 nov. 2022, En: Frontiers in Plant Science. 13, 1006044.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto6 Citas (Scopus) -
2021
ConnecTF: A platform to integrate transcription factor-gene interactions and validate regulatory networks
Brooks, M. D., Juang, C. L., Katari, M. S., Alvarez, J. M., Pasquino, A., Shih, H. J., Huang, J., Shanks, C., Cirrone, J. & Coruzzi, G. M., 2021, En: Plant Physiology. 185, 1, p. 49-66 18 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto29 Citas (Scopus) -
Genomic Footprinting Analyses from DNase-seq Data to Construct Gene Regulatory Networks
Moyano, T. C., Gutiérrez, R. A. & Alvarez, J. M., 2021, Methods in Molecular Biology. Humana Press Inc., p. 25-46 22 p. (Methods in Molecular Biology; vol. 2328).Producción científica: Contribución a los tipos de informe/libro › Capítulo › revisión exhaustiva
3 Citas (Scopus) -
Time-Based Systems Biology Approaches to Capture and Model Dynamic Gene Regulatory Networks
Alvarez, J. M., Brooks, M. D., Swift, J. & Coruzzi, G. M., 17 jun. 2021, En: Annual Review of Plant Biology. 72, p. 105-131 27 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
21 Citas (Scopus) -
2020
A balancing act: How plants integrate nitrogen and water signals
Araus, V., Swift, J., Alvarez, J. M., Henry, A. & Coruzzi, G. M., 25 jul. 2020, En: Journal of Experimental Botany. 71, 15, p. 4442-4451 10 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
Acceso abierto59 Citas (Scopus) -
Nitrate in 2020: Thirty years from transport to signaling networks
Vidal, E. A., Alvarez, J. M., Araus, V., Riveras, E., Brooks, M. D., Krouk, G., Ruffel, S., Lejay, L., Crawford, N. M., Coruzzi, G. M. & Gutiérrez, R. A., jul. 2020, En: Plant Cell. 32, 7, p. 2094-2119 26 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
Acceso abierto218 Citas (Scopus) -
Nutrient dose-responsive transcriptome changes driven by Michaelis–Menten kinetics underlie plant growth rates
Swift, J., Alvarez, J. M., Araus, V., Gutiérrez, R. A. & Coruzzi, G. M., 9 jun. 2020, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 23, p. 12531-12540 10 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto36 Citas (Scopus) -
Transient genome-wide interactions of the master transcription factor NLP7 initiate a rapid nitrogen-response cascade
Alvarez, J. M., Schinke, A. L., Brooks, M. D., Pasquino, A., Leonelli, L., Varala, K., Safi, A., Krouk, G., Krapp, A. & Coruzzi, G. M., 1 dic. 2020, En: Nature Communications. 11, 1, 1157.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto94 Citas (Scopus) -
2019
Local Changes in Chromatin Accessibility and Transcriptional Networks Underlying the Nitrate Response in Arabidopsis Roots
Alvarez, J. M., Moyano, T. C., Zhang, T., Gras, D. E., Herrera, F. J., Araus, V., O'Brien, J. A., Carrillo, L., Medina, J., Vicente-Carbajosa, J., Jiang, J. & Gutiérrez, R. A., 2 dic. 2019, En: Molecular Plant. 12, 12, p. 1545-1560 16 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto32 Citas (Scopus) -
Network Walking charts transcriptional dynamics of nitrogen signaling by integrating validated and predicted genome-wide interactions
Brooks, M. D., Cirrone, J., Pasquino, A. V., Alvarez, J. M., Swift, J., Mittal, S., Juang, C. L., Varala, K., Gutiérrez, R. A., Krouk, G., Shasha, D. & Coruzzi, G. M., 1 dic. 2019, En: Nature Communications. 10, 1, 1569.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto91 Citas (Scopus) -
2017
Nitrate induction of root hair density is mediated by TGA1/TGA4 and CPC transcription factors in Arabidopsis thaliana
Canales, J., Contreras-López, O., Álvarez, J. M. & Gutiérrez, R. A., oct. 2017, En: Plant Journal. 92, 2, p. 305-316 12 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
104 Citas (Scopus) -
Nitrate signaling and early responses in Arabidopsis roots
Undurraga, S. F., Ibarra-Henríquez, C., Fredes, I., Álvarez, J. M. & Gutiérrez, R. A., 1 may. 2017, En: Journal of Experimental Botany. 68, 10, p. 2541-2551 11 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
Acceso abierto74 Citas (Scopus) -
2016
Mapping transcription factor interactome networks using HaloTag protein arrays
Yazaki, J., Galli, M., Kim, A. Y., Nito, K., Aleman, F., Chang, K. N., Carvunis, A. R., Quan, R., Nguyen, H., Song, L., Alvarez, J. M., Huang, S. S. C., Chen, H., Ramachandran, N., Altmann, S., Gutiérrez, R. A., Hill, D. E., Schroeder, J. I., Chory, J. & LaBaer, J. y 3 otros, , 19 jul. 2016, En: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113, 29, p. E4238-E4247Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
58 Citas (Scopus) -
2015
The calcium ion is a second messenger in the nitrate signaling pathway of Arabidopsis
Riveras, E., Alvarez, J. M., Vidal, E. A., Oses, C., Vega, A. & Gutiérrez, R. A., sep. 2015, En: Plant Physiology. 169, 2, p. 1397-1404 8 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto189 Citas (Scopus) -
Transcriptional networks in the nitrate response of Arabidopsis thaliana
Vidal, E. A., Álvarez, J. M., Moyano, T. C. & Gutiérrez, R. A., 1 oct. 2015, En: Current Opinion in Plant Biology. 27, p. 125-132 8 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
69 Citas (Scopus) -
2014
Nitrate regulation of AFB3 and NAC4 gene expression in Arabidopsis roots depends on NRT1.1 nitrate transport function
Vidal, E. A., Álvarez, J. M. & Gutiérrez, R. A., 2014, En: Plant Signaling and Behavior. 9, APR, e28501.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto67 Citas (Scopus) -
Systems approach identifies TGA1 and TGA4 transcription factors as important regulatory components of the nitrate response of Arabidopsis thaliana roots
Alvarez, J. M., Riveras, E., Vidal, E. A., Gras, D. E., Contreras-López, O., Tamayo, K. P., Aceituno, F., Gómez, I., Ruffel, S., Lejay, L., Jordana, X. & Gutiérrez, R. A., 1 oct. 2014, En: Plant Journal. 80, 1, p. 1-13 13 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
Acceso abierto237 Citas (Scopus) -
2012
Integration of local and systemic signaling pathways for plant N responses
Alvarez, J. M., Vidal, E. A. & Gutiérrez, R. A., abr. 2012, En: Current Opinion in Plant Biology. 15, 2, p. 185-191 7 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo de revisión › revisión exhaustiva
128 Citas (Scopus) -
2009
Expression of genes encoding laccase and manganese-dependent peroxidase in the fungus Ceriporiopsis subvermispora is mediated by an ACE1-like copper-fist transcription factor
ALVAREZ HERRERA, J. M., Canessa, P., Mancilla, R. A., Polanco, R., Santibáñez, P. A. & Vicuña, R., ene. 2009, En: Fungal Genetics and Biology. 46, 1, p. 104-111 8 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
65 Citas (Scopus) -
2008
The copper-dependent ACE1 transcription factor activates the transcription of the mco1 gene from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
Canessa, P., Polanco, R., ALVAREZ HERRERA, J. M., Bull, P. & Vicuña, R., feb. 2008, En: Microbiology. 154, 2, p. 491-499 9 p.Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
20 Citas (Scopus)